Table 2 Project information

MIGS 31

Finishing quality

Finished

MIGS-28

Libraries used

Fragments

MIGS 29

Sequencing platforms

Ion Torrent PGM

MIGS 31.2

Fold coverage

115× (MEX1); 129× (MEX9); 99× (MEX25); 135× (MEX29); 81× (MEX30); 123× (MEX31).

MIGS 30

Assemblers

Newbler, SPAdes.

MIGS 32

Gene calling method

RAST

Locus Tag

CpMEX1_ (MEX1); CpMEX9_ (MEX9); AN397_ (MEX25); CpMEX29_ (MEX29); CpMEX30_ (MEX30); CpMEX31_ (MEX31);

Genbank ID

CP017711 (MEX1); CP014543(MEX9); CP013697 (MEX25); CP016826 (MEX29); CP017291 (MEX30); CP017292 (MEX31);

GenBank Date of Release

2017/01/30 (MEX1); 2016/05/27 (MEX9); 2015/12/23 (MEX25); 2016/11/03 (MEX29); 2016/12/27 (MEX30); 2016/12/27 (MEX1);

GOLD ID

- (MEX1); Go0366057 (MEX9); Go0139540 (MEX25); Go0364114 (MEX29); Go0364489 (MEX30); Go0364678 (MEX31);

BIOPROJECT

PRJNA348354 (MEX1); PRJNA312392 (MEX9); PRJNA294672 (MEX25); PRJNA335634 (MEX29); PRJNA343017 (MEX30); PRJNA341961 (MEX31);

MIGS 13

Source Material Identifier

BHI broth

Project relevance

Animal Pathogen, Medical