Skip to main content

Table 1. Mycobacterium species sharing identical 16S rDNA sequences.

From: Standard operating procedure for optimal identification of mycobacteria using 16S rRNA gene sequences

 

16S rDNA similarity %

Species

first 500 bp

whole gene

M. abscessus, M. bolletii, M. chelonae, M. massiliense

100

100

M. abscessus, M. chelonae

100

99.7

M. africanum, M. bovis, M. bovis BCG, M. caprae, M. microti, M. pinnipedii, M. tuberculosis

100

100

M. alvei, M. setense

100

99.1

M. barrassiae”, M. moriokaense

100

99.6

M. bolletii, M. chelonae

100

99.7

M. chelonae, M. massiliense

100

99.7

M. conceptionense, M. houstonense

100

99.7

M. conceptionense, M. senegalense

100

100

M. farcinogenes, M. fortuitum, M. houstonense, M. senegalense

100

100

M. gastri, M. kansasii

100

100

M. houstonense, M. senegalense

100

100

M. marinum, M. ulcerans

100

99.8

M. mucogenicum, M. phocaicum

100

100

M. murale, M. tokaiense

100

100

M. paraseoulense, M. seoulense

100

100

M. peregrinum, M. septicum

100

99.7

M. vaccae, M. vanbaalenii

100

99.3